日本ハンズオンユニバース協会会則で明記されているように事務局は埼玉県和光市広沢の理化学研究所内 にあります（第１章 総則 第２条 事務局）。事務局では、対外的な窓口業務（メディアや一般の方々からの 問い合わせなど）、Webの整備、MLの管理、集会やイベントの広報・配布物の作成などの準備、会計、名簿管理、TRAのサポートを行っております。

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